靖难之役，道衍并未随着大军征战，而是坐守北平。与南军的冥战，都是道衍在幕后，指导青冥卫。而每一个计划步骤，都是道衍把消息传递给郑和。也就是说，郑和就是青冥卫的实际领导者，青冥卫一干术士，全部听从于郑和。
每当战事紧张，而道衍的应策来不及到达燕军，都是郑和当机立断，做出决策，多次拯救朱棣于兵败之中。而且郑和的决断，往往和道衍随后传递到的命令，并无区别。
朱棣夺了朱允炆的皇位，天下平定，道衍就有了收留马三宝为徒的打算。诡道在席应真之上，已经几十代都是单传，从前的两房传承的规矩，已经名存实亡。这个情况，从隋末唐初就已经开始，当时诡道参与了道教两大流派——铲教和截教的争端，刚好长房跟随了铲教，而幺房跟随了截教。
当时诡道的司掌是幺房李密，不过最终也不能力挽狂澜，截教败给了铲教，截教的高深术士，在红水阵一战，全军覆没。这个道教之间的内部杀伐历史，后来在明朝被许仲琳写成了小说，把时间放到了西周伐殷的年代，并且极尽夸张之能事，叙述了很多道教从来没有使用过的大阵法。这个小说就是《封神演义》。
李密虽然在铲教截教的冥战中，支持截教，剿杀了诡道长房。但是最终支持李唐的铲教布下了红水大阵，获得了冥战的胜利。
从此，中国道教以铲教为宗，截教就再也不能死灰复燃。从大唐一朝，举国推崇道教，实际就是李唐对铲教的赏赐，只是在武则天时期，大兴佛教。道教才稍稍式微。武周之后，又重新崛起。
而诡道就没有这么好的运气，李密之后，诡道因为支持过截教，也被打压。所以，从唐，至五代十国，到北宋，诡道渐渐没有了动静，悄无声息，只是在民间暗自流传，因为李密当年和长房的相互残杀，让诡道传人记忆深刻，诡道每代只传一个弟子，避免两房相互残杀的诅咒。又加上诡道的门人本领低微，所以诡道已经沦落到民间普通占卜巫师的境地。到了北宋，诡道的流传更加艰难。于是诡道恢复古老的规矩，收了长幼两房弟子。可是诡道的诅咒仍旧不能解除，长幼两房相互交恶，自相残杀。只留下一个年幼的传人，眼见诡道就要断代。
当时斩鬼宗师黄裳，不知道因为什么缘由，破除诡道成见，做了诡道的挂名。并且把自己用百鬼修炼的螟蛉交给了诡道，作为镇教之宝。诡道才又勉强流传。可是黄裳挂名之后，诡道的传人仍旧资质平平，由南宋到元朝，默默无闻。
直到元朝后期，诡道终于出了一个高手，那就是席应真。席应真的本领强过诡道之前数代祖师，已经和当时最有名望的道教宗师刘基不相上下。于是有了振兴诡道的心思。
后来的情况也知道，席应真投靠陈友谅，刘基投靠朱元璋。席应真一败涂地，不过他收了几百年不世出的人杰姚广孝为传人，也就是道衍，道衍归附燕王朱棣，才报了师门仇恨，诡道的兴盛，莫过于此。
现在道衍位极人臣，看到郑和也是一个杰出的人才，就要把郑和收纳为徒弟，传承诡道。
可是这个提议，被郑和给拒绝了。
道衍不解，郑和才告诉道衍，自己是伊斯兰开宗大圣穆罕默德的三十七世孙，终生不能背弃伊斯兰教。
道衍也就不能强求，只能另行寻找传人，可惜再也找不到如郑和一般的人物，道衍之后，诡道再次重回民间小门派的地位。这也是道衍无法可想的事情。（直到几百年后，古赤萧横空出世，让诡道威震天下，那是后话，在冥战部细细讲述。）
郑和拒绝了国师道衍光大诡道的提议，道衍也并没有为难郑和，仍旧履行当年的承诺，碰巧有朱允炆出逃海外的流言，于是道衍在朱棣的授意下，建造宝船，让郑和下西洋，探海路，回祖先的发源地麦加朝圣。
永乐三年，一切准备充足，郑和率领宝船船队，从海边港口出发，经福建到占城（今越南）、爪哇（今印尼）、锡兰（今斯里兰卡），到了古里（今印度东海岸）。由于航海图并不详尽，郑和无法再向西行。只好班师回朝，回到南京。
与陆路寻找的胡濙一样，郑和也没有找到朱允炆的下落。
朱棣大为不悦，郑和请缨，永乐五年再下西洋。和胡濙的第二次奔赴云南同样道理，郑和的二下西洋，仍然是无功而返。
郑和回报朱棣和道衍，他在爪哇等地寻找汉人移民，遍访朱允炆的下落，也只是听到一些传闻。并且传闻说朱允炆知道朱棣派遣郑和到南洋，已经躲避到了更西的番外之地。那个番外之地，住的全部是肤如黑炭的夜叉修罗后代，不是中土的子民。那番外之地，距离中土几万里遥远。海图上并未标明。
朱棣为了寻访朱允炆下落，调拨国库，再次兴建大船，让郑和三下西洋探出去往番外夜叉修罗的海路。
于是郑和三下西洋。
郑和出发的当日。胡濙也修养好了身体，第三次出发，动身到西南，一方面是为了完成寻找朱允炆的下落，另一方面是他的赤线蛊在脑内发作的日期临近，需要找到解救的办法。
而由于胡濙几年来一直养病，身体孱弱，于是道衍安排其时已经是青冥卫大统领的黄铁俞跟随胡濙，一路照应。
郑和与胡濙寻找朱允炆的下落暂且不提。
道衍身为明朝国师，他有更重要的事情要布置。那就是扶持张三丰，一统道教，镇压民间教派。
张三丰本是全真道人，本名张君实，当时的炼丹士，在湖北武当山结庐修炼。在靖难之役前夕，胡濙举荐张三丰，被道衍邀请到北平。
张三丰本来已经是全真教派最有名望的道士，而道衍是当朝国师，诡道司掌。两人本来门派各异，但是一见之下，道衍和张三丰十分谈得来。
张三丰当时就答应，着手帮助道衍组建青冥卫，并且运用自己在道教中全真、王屋、崂山的影响，让道教宗派置身事外。
道衍得到了张三丰的支持，所以靖难之役里，道教正宗都没有投奔南京的正统朝廷。道衍的冥战胜利，张三丰实在是功不可没。
但是张三丰之所以鼎力帮助道衍和朱棣。是因为，张三丰得到了道衍和朱棣的承诺，让他建立一个道教宗派，超出全真和王屋、茅山各个宗派。
这个门派，就是武当。
当时明朝初定，天下还有不少民间教派鼓动信徒造反。其中尤以白莲教影响最广。张三丰得了道衍的指派，于白莲教的道魁比拼法术。白莲教其实和朱元璋大有渊源，当时都是摩尼教的分支，朱元璋建国之后，反而回头铲除当年的教众，这也是帝王不能免俗的作为。
永乐之时的道魁是个女的，法术能力高超，聚了几万信徒起事，张三丰于是在明军镇压白莲教的战争中，利用法术和白莲教的一干教中高手比拼。
张三丰的本领谋略，在当时只在道衍之下，在青冥卫是个散人，能力声望，与郑和不相上下。白莲教的术士哪里是张三丰的对手。
张三丰帮助朱棣剪除了白莲教，让白莲教元气大伤。不能再兴风作浪。于是朱棣和道衍也信守承诺。帮助张三丰建立道教门派，统领天下道教。
第一件事情，就是在武当山修建道观。