北洋水师聘用的洋员顾问泰莱和瑞乃尔等看到刘公岛被围困，为了活命主张投降，与威海卫水陆营务处提调牛昶昞商量投降办法，计划着由洋员去劝说提督丁汝昌投降。
9日凌晨2时，泰莱与瑞乃尔来劝丁汝昌投降，被严词拒绝。劝降失败后，又与马格禄、浩威等策划以众相逼。
但是他们仍然遭到了丁汝昌的言辞拒绝，并且将这些人斥退。
11日，眼看援军无望，丁汝昌召集诸将和洋员顾问会议，会议从上午一直开到午后，他提出舰队突围主张，却遭到牛昶昞与洋员等联合反对。无奈之下，丁汝昌下令将提督印戳角作废，以防有人盗印投降。
会议无果，万分失望的丁汝昌晚饭也没吃，一直枯坐在桌旁，面对着挂在墙上地图，眼看着曾经辉煌的北洋水师，为什么那么快就被吞食。是自己的原因吗?还是别的原因？为什么求援的密信发出去了这么久，没有得到回音，还不让出战？带着种种的遗憾，他服毒自杀了。
顾问洋员美国人浩威假借丁汝昌的名义起草降书。其实提督印当时被故意藏了起来，并未被戳角毁坏。
14日，牛昶昞以海陆军代表身份登日海军松岛舰，与日本联合舰队司令伊东佑亨签订“威海降约”11条，将北洋舰队残余的11艘军舰、刘公岛炮台及军资器械，全部移交日军。
战争打到这个地步，清朝政府自决已经没法再打下去了，于是朝廷任命李鸿章为特命全权大使前往日本进行和谈事宜。
2月14日，李鸿章及其子李经方，美国顾问科士达，离天津去日本，20日在日本马关春帆楼与日首相伊藤博文、外相陆奥宗光开始谈判。
谈判过程中，日本肆意勒索，所提各项条款，只准李鸿章说“允、不允两句话而已”，并时时以战争再起和进攻北京相威胁。
73岁的李鸿章虽然极尽周旋，但谈判几次没能成功而峰回路转，当时一名日本人偷袭李鸿章，用枪击中其左脸。他瞬间血流不止，应声倒地。
当时负责谈判的伊藤博文，听到这个消息之后，气得直吐血。他也害怕谈判就此破裂，要知道在当时日本战争潜力几乎已经被挖尽了，如果继续战斗下去，恐怕财政就无法支撑了，现在他们如此强硬，也不过是外强中干。
于是伊藤博文急忙乘车亲自前去慰问李鸿章，并且向李鸿章保证一定会严惩凶手。
而李鸿章也知道现在清朝的那些人是怎么想的，他们只想快速求和，再加上自己的北洋已经几乎是全军覆没也无力再战，而南洋的刘海又是坐山观虎斗，看来是指望不上，为了能够早点结束战争，李鸿章也只能暂时的忍耐。
于是李鸿章并没有离开日本，而是就地养伤，在伤势稍稍好转之后就立刻投入了谈判。
而伊藤博文等人也害怕，如果继续强硬下去，李鸿章会自暴自弃，就此停止谈判，于是主动将3亿两白银的赔款降低到了2亿两。
可谓是一枪减少一亿两，后人也因此评价他为“一把骨头一把泪为清廷节省一亿两，为清廷的苟延残喘做出了极大贡献”。
至此，把关条约的所有协议几乎都达成了共识，几天之后双方正式签订了协约。
三月二十三日，李鸿章被迫在协约上签了字。条约共十一款，附有“另约”和“议订专条”。
主要内容为：一、中国承认朝鲜为“完全无缺之独立自主”；二、中国割让台湾全岛及所有附属各岛屿、澎湖列岛和辽东半岛给日本；三赔偿日本军费库平银二万万两；四、开放沙市、重庆、苏州、杭州为通商口岸，日船可沿内河驶入上述各口搭客装货，日本政府得在通商口岸设立领事官；五、日本臣民可在中国通商口岸城邑任便设立工厂、输入机器，只交所订进口税，日本在华制造的一切物品得免征各项杂税，所有日货均可设栈寄存；六、交换俘虏，中国即行释放日本军事间谍或被嫌逮之日本臣民。四月初八日，清政府批准了这一丧权辱国的条约。四月十四日，中日双方在烟台互换批准书，“协约”开始生效。
而这个时候一直在南京蛰伏的刘海在得到大清国政府同日本签订丧权辱国的协约之后，立刻大喜过望，对着左右的幕僚说道：“此天赐良机，正是我南洋飞龙在天之时。”
当天晚上刘海就写了一封奏折，命人送到了京师。
在这封奏折之中，刘海痛斥了朝廷上的卖国贼李鸿章等人，然后用假模假样的说道，台湾乃是祖宗百战所得，不可轻弃。接下来又诉说台湾在大清海疆的战略重要位置，同时说明台湾是南洋水师基地所在，愤慨的请求朝廷废约再战。
刘海的奏折再送到朝廷之后，立刻就引起了一片的喧哗。
慈禧等投降派自然是不愿意，本来已经得到和平的机会，怎么能就这么再次开战？
而像光绪皇帝等主战派，对于这一次的马关条约苛刻的条件，是已经愤慨到了极点？
要知道大清国和列强打交道这么多年以来，从来就没有做出过这样大的让步。
就连世界第一强国英国也没有办法逼迫大清国签订这样的协约，现在竟然被一个小小的日本所达成了。
因为在朝廷上对于日本小视的习惯，由来已久，这些官老爷们能够接受大清国被洋人打败的事实，却无法接受大清国被日本人击败的现状。因此不满的人大有人在。
而刘海的这个奏折，自然引起了满朝上下文武大臣的共鸣。
就连光绪皇帝再接到刘海的奏折之后，也是兴奋异常连续，召集大门武大臣商量了几天，准备不承认马关条约，继续命南洋水师全军出动，与日本海军决战。
但是刘海的奏折，却遭到了慈禧太后强力的压制，甚至有一次在光绪皇帝召开大朝的时候，慈禧太后竟然破例地从颐和园出来来到了乾清门。
慈禧太后对着满朝文武咆哮着，痛斥刘海不知高低，只之一时的血勇，却不把国家大义放在心上。
同时话中明里暗里说刘海在北洋同日本人大战的时候，坐山观虎斗，坐看北洋水师全军覆没。
由于慈禧太后的强力压制，刘海的这封奏折就被朝廷弃用，同时光绪皇帝不得不发了一封圣旨，痛斥刘海无端引起友邦猜疑，命令由刘海约束手下不得再战。
刘海在接到这封圣旨之后，立刻就着急了，自己的幕僚商议下一步该如何行事。
江宁人赵传仁上一次出的主意被刘海弃用之后，一直耿耿于怀，这一次得的机会自然要在刘海面前露个脸，于是他当先出来，“大人，朝廷如此行事，已是天下民心，大人不必理会，只要大人立刻出兵与日本人决战，天下民心就在大人这一边，朝廷到时候投鼠忌器也无可奈何。”
而作为刘海头号幕僚的赵家华，这一次破例同意了赵传仁的意见，“大人，日本和北洋水师决战之后已经是强弩之末，我等现在出击正是时机。”
其他的几个幕僚对于这二人的意见也是纷纷的赞同，他们已经看出来了，经过这一次朝廷可以说是威望扫地，地方上的势力越发的膨胀，而作为两江总督的刘海，现在已经成为了朝廷第一大的实权派，将来的前程不可限量。
而现在正是刘海争取民心，布武天下的时机。
刘海坐在上边，听着底下几个幕僚的议论，满意的点点头，这一回自己背上了卖国贼的名声，终于等到了这个时机。
于是刘海站起身来对着下边的人说道：“日本乃是蛮夷小国，窥视我天朝久已，今日携小胜，只为逼迫朝廷签订如此丧权辱国的条约，不但赔偿白银2亿两，而且割让我南洋水师重地台湾，如此奇耻大辱，南洋怎能忍让？本督决定，两江地区立刻进入战备状态，南洋水师立刻出航，寻找日本海军决战。”
刘海作出决定之后，他的命令迅速就像两江地区传出，刘海麾下的三十万陆军接到刘海的命令之后，立刻整顿人马，把守两将各要地！
刘海命令陆军准备，倒不是因为害怕日本人偷袭，他这个防御的目标恰恰是本国人。
刘海害怕他领大军在外的时候，清国朝廷突然发难，到时候他的老家就没了。
刘海再给部队发布命令之后，接着又向全国通电：日本嚣张，视我大清如无物，满朝大臣，只知议和不知血战，今我南洋将士，绝不受此大辱，特此通遍全国欲与日本决一死战。
北京的朝廷接到刘海的通电之后吓得直哆嗦，这是干什么？这是要造反呀。
但是现在北洋已经被被日本人打残了，朝廷还真没有办法，对刘海有任何的威胁，于是只能是连续发电报，让刘海稍安勿躁。
日本在得到刘海的通电之后，也是吓了一跳，他们现在虽然得到了北洋很大的一批军舰，但是这些军舰还没有完全整修完成，现在和南洋水师决战，还没有必胜的把握，于是他们立刻就联系了英法美等国的领事，请求他们联合干预刘海的行动。