《明日议定书》的签订很快就通过菊机关的秘密渠道传到了城外，第一个知道此事的是正在攻击日军松平定胜部的第二步兵联队长陈广睿。
御马监腾骧右卫总旗出身的陈广睿，对于所谓的《明日议定书》十分的不满，认为这是那个没鸟的副使擅自主张。
因为，根据议定书中的内容，皇帝亲军将士奋勇远征，换来的不过是帮助日本的鸟国王复政，这算什么？
“老子不懂政治，老子只知道倭人的京城就在眼前，白花花的银子和女人等着弟兄们去拿，怎么反过来就要弟兄们保护这屁城呢！”
陈广睿“呸”了一口菊机关的信使，恨恨的要抽对方一鞭子。边上的参谋副官渡边赶紧拦住，低声劝说联队长阁下赶紧将此事上报。
“妈拉个巴子，你找两人把这家伙送到后面去。”
陈广睿气冲冲的来到前沿，透过千里镜看到有几个戴着面具的日军将领正在朝皇军这边指点什么，看架势没将第二步兵联队先前发起的进攻放在眼里。
陈广睿恼了，马上命令第一大队组织第二拨进攻，一定要将这股卡在日本京城前的最后一根骨头拔掉。
自打随师团进入台湾后，陈广睿已经一年多没有回过本土，加上对日作战以来，他的联队损失很大，不少一直跟随他的部下都阵亡了，因而心中很是憋着一股火气。
“谁能把松平定胜的首级给老子拿来，老子升他三级！”
下了重赏后，陈广睿竟然又紧跟着发布了一条命令，他对军官们道：“告诉弟兄们，进了日本人的京城，老子给他们放十天假！”
“阁下，这似乎不妥吧？”
渡边参谋负责联队和师团的联络及军令事务，不管是军方面还是师团方面，都不曾有指示对京都可以破坏，因此他要提醒联队长阁下不要轻易做出上面不许可的事情。
“没什么不妥，弟兄们饿着肚子打到这里，不让他们进去快活一次，老子对不住他们！”
陈广睿固执己见。
联队长的命令下达之后，整个联队的官兵为之兴奋起来，哪怕那些日本籍的官兵也都欣喜的手舞足蹈起来。
有军官的许可，在利益的刺激面前，军纪自然就会变坏。
眼面前的可是日本的京城啊！
那里有多少达官贵人，又有多少财富呢！
渡边见无法劝阻联队长，只能暗叹一声，将此事迅速上报。
与此同时，正与日军进行交战的第一联队、第五联队的官兵们都接到了来自联队本部命令，这些命令虽然在行文上有所区别，但竟然跟第二步兵联队的命令大体一致。
常石杀降事件的后果出现了。
对放下武器日军的大规模屠杀无疑刺激到了整个皇帝亲军，在部分极端军官的煽动和刻意组织下，事态向着大本营根本无法阻止、甚至无法预见的一面滑去。
第五步兵联队的一个中队在俘虏了几百日军之后，未经请示就将这些俘虏全部坑杀。
“由于日军的迅速瓦解，我皇军各部队的神勇快速推进，约有万余日本兵被切断了退路。他们丢下武器向我军投降。然我军兵力有限，要处理如此众多的俘虏，粮食方面的保证根本无法实现。因此，我擅自向所属各部队发出命令，要他们效仿常石事件，全部处决掉这些俘虏。”
本来负责收容俘虏的工兵联队长安国寺一夜之间处决了一万余俘虏。常石事件之前，安国寺曾向大本营进言，要善待俘虏。
第三步兵联队的一个大队俘虏了一千多日军，他们不知道怎么办，在听说后方发生了常石事件后，这个大队立即将俘虏们全部处决掉。
临时抽调入日的台湾警备师团第一步兵联队长魏广生是魏公公的九太爷，在到达日本编入第一军序列后，魏广生就经常与第一军各联队长联络。
常石事件没有发生前，魏广生就经常说干嘛要接受那些倭兵的投降，统统杀了不是省事得。早几十年前嘉靖爷那会，可不见倭寇对我皇明子民有善待的。老辈人可都说了，那东南沿海的百姓叫倭寇们祸害的惨了噢。
这等带有强烈复仇的言论自然引起了大本营参谋长官蒋西凤的反感，他向魏公公建议将其调离，但建议多次却未能获得同意。
此事令得魏广生产生错觉，以为他侄重孙是在默许他行事。于是，魏部一路可谓是烧杀抢掠，所过之处几成赤土。
又因魏部肃宁子弟众多，此后数月甚至长达两年，肃宁籍皇军官兵不断将从日本抢掠的财货运往家乡，使得从前的北直隶有名的贫困县摇身一变成了全省有名的富裕县。
多远的姑娘都要嫁到肃宁，意外的解决了肃宁两百年来的出太监的臭名，导致天启年间宫中太监定额大大不够。
九千岁魏忠贤对侄儿感慨道：“咱咧给皇爷做一辈子没能让家乡百姓过上好日子，你小子出海晃一圈倒是成了家乡的活菩萨咧。赶明让他们别再立咱的生伺了，都立你的，都立你的。”
最让大本营震怒的不是魏公公的九太爷，而是第一步兵联队长，也是常石事件的主要责任人真田一郎。
其在第一步兵联队官兵演说中公开宣称，说什么幕府的一切都是我们的敌人，哪怕山川草木也是！
常石事件之后，真田下发了一道密令，“凡在京都以及京都附近的战场，一般的日本百姓，纵令是老人、女人或者小孩，部队都要严加注意。近期不断发生我联队官兵被日军单独兵袭杀事件，故不能粗心胆大，需要特别注意，尤以后方部队为然。如果发现这些行为，一律不宽恕，必须采取断然处置。”
第六步兵联队长李炎昭宣称：“京都是日本的京都，也是皇明的京都。皇军对京都的占领是帝国意志的贯彻，因此不允许京都存在任何幕府的流毒！”
这些将领的种种言论无疑加深了皇军在京都作为的恶劣性，使得皇军在相当长的一段时间内军纪十分的败坏。
可让人难以理解的是，对前线各部队的胡作非为，身为最高统帅的魏公公竟然未做任何阻止。
甚至多年后在一次采访中，魏公公说自己当时在台湾平定土蛮时的旧伤发作，因此无法有效指挥部队。故对于原日本国京都发生的诸事件，公公本人并不清楚。
事件中，可能有平民被误杀，对此，公公本人一直是愧疚的，所以他后来向皇帝请命兼任日本镇守太监，便是想为日本的发展做一些贡献，以抚平战争给日本人民留下的创伤。
采访结束后，公公善意的提醒采访的《皇明日报》记者：“过去的事情就不要再翻了，京都事件帝国早已经定性，一些吃饱了撑的文人妄想通过此事翻案，明面上是想深挖历史真相，但实际上矛头却是对准咱家的。对这些人，我们必须警惕，我活着他们不敢闹，我要死了，指不定就得被他们鞭尸咧。我看咧，对这些人不敲打一下不行啊，早年间的学习班有必要再开几期，读书人嘛，脑子总是不切实际。”
这次的报道和随后的相关措施起到了很好的效果，但有一点魏公公并没有说真话。
他一直在前线。
就在皇军攻占京都的第二天，魏公公就带领卤薄参加了入城式，并亲手为对日作战以来阵亡将士擂响了汉唐年间的旧乐招魂鼓，以求皇军将士魂兮归来，永震倭国。
入城式上，天降灰雪。
此是城外正在焚烧死者残骸，因数量太多难以计数，行人于二三里外望如积雪。
次日，魏公公亲自召见曹文耀、伍福铭、真田一郎、山本幸二、李炎昭、汪大海等第一军高级将领，对他们攻克京都予以嘉勉，并各赠宝刀。
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常石发生的事件很快就被当地的日本村民传了出去，数千日本士兵及将军长子的被杀让幕府方面人心为之一滞。
明国军队官方对外声称德川家光乃是诈降，因此皇帝亲军采取了必要措施以防止事态恶化。
但是私底下，正在执行对京都攻击作战的皇军将领们却对部下们声称，对待敌人就应当施以残酷，今后作战也必须对幕府军队进行实质的消灭。
菊机关及复兴社方面的宣传口径出奇的一致，那就是帝国从来不以德川幕府为作战对象，因而不必给予德川幕府军队格外的人道关怀。
受到常石事件影响，尤其是参与镇倭的部队官兵斗志更加昂扬，官兵们克服种种困难，有力杀伤当面日军，迫使倭酋德川秀忠不得不弃军东撤。
就在身受丧子之痛的德川秀忠无奈东撤时，不知从哪个途径竟然流传出天皇陛下的御旨，说凡是在幕府替德川家效力的，以及帮助德川家的都属于“非国民”，一旦幕府倒台，朝廷就将清算这些“非国民”。
同时，皇帝亲军新的告日本人民书也迅速在日本全境传递，“谕日本官绅军民人等知道......如有抗拒不遵，大兵一到，玉石俱焚，尽行屠戮！”
向皇帝陛下报喜的捷报与向教皇陛下报喜是同时进行的。